中国农业大学研究生院现有硕士学位授权一级学科37个，171个硕士学位授权点，10个硕士专业学位类型及专业学位领域37个;拥有 12个国家级重点学科，19个部级重点学科，11个博士后流动站。其中植物保护、作物学、畜牧学、兽医学、食品科学与工程、农业资源与利用、农业工程等一级学科在近年的一级学科整体水平评估中排名全国第一，已经形成了包括硕士、博士和专业学位教育的较完善的研究生教育教学与管理体系，并且对全国农科研究生教育事业的发展起到了示范作用。
2017年，中国农业大学硕士生招生规模约2060人，其中学术型硕士研究生约1300人，专业学位硕士研究生约760人。各专业(领域)招生人数详见《2017年中国农业大学硕士研究生招生专业目录》|招生简章。
中国农业大学实行对考生的入学考试总成绩(含初试与复试)进行排名，择优录取的招生办法。复试成绩不及格者不予录取。录取名单在招生学院和研究生招生信息网上公示一周，有异议者可以通过公布的监督电话进行举报。